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Schulungsübersicht
Einführung in Fiji und ImageJ
- Überblick über Fiji und seine Anwendungen in der wissenschaftlichen Forschung
- Verständnis der Architektur und der Plugins von ImageJ
- Installieren und Einrichten von Fiji für optimale Leistung
Grundlegende Bildverarbeitungstechniken
- Bilderfassung und Importformate
- Einstellen von Kontrast, Helligkeit und Anwendung von Filtern
- Bildstapelung und Projektionsmethoden
Fortgeschrittene Image Analysis
- Segmentierungstechniken: Schwellenwertbildung und Kantenerkennung
- Objektzählung und Partikelanalyse in histologischen Proben
- Messen von Flächen, Umfängen und anderen morphologischen Merkmalen
Arbeiten mit Biologischen Mustern
- Verarbeitung von Bildern von histologischen Geweben, Blutzellen und Algen
- Farbentfaltung und Analyse von gefärbten Geweben
- Zeitrafferanalyse und Verfolgung von Zellbewegungen
Automatisierung und Anpassung
- Erstellen und Ausführen von Makros für sich wiederholende Aufgaben
- Verwendung von Fiji-Plugins für spezielle Analysen
- Grundlegende Skripterstellung mit ImageJ Macro Language (IJM)
Data Management und Berichterstellung
- Exportieren von Ergebnissen und Erstellen von Berichten
- Kommentieren von Bildern und Aufbereiten von Daten für die Veröffentlichung
- Bewährte Praktiken für eine reproduzierbare Bildanalyse
Zusammenfassung und nächste Schritte
Voraussetzungen
- Grundlegendes Verständnis von Konzepten der biologischen Bildgebung
- Vertrautheit mit Mikroskopie und histologischen Techniken
- Grundlegende Computerkenntnisse
Zielgruppe
- Forscher im Bereich Biotechnologie und Umwelttoxikologie
- Labortechniker, die mit histologischer und zellulärer Bildgebung arbeiten
- Wissenschaftler mit Interesse an quantitativer Bildanalyse
14 Stunden
